9.そうなるとLPモードでは設計の不備からディスク容量の10%が無駄になるではないか！

はい。
ソニーはプレイヤーに対して未知のトラックは無視するという"フラグ"をオリジナルのＭＤ仕様書に
定義することは容易に出来たはずである。とにかく彼らはこの可能性を見落としてしまった。