舞台は19世紀末のニューヨーク。
天才科学者アレクサンダー・ハーデゲンは、婚約者のエマを目の前で強盗に殺されたことから、
「時間を逆戻りしてエマを助けたい」という思いに取りつかれる。それから４年。
アレクサンダーはついにタイムマシンを完成させて、エマが死ぬ直前の世界に戻っていく。
だが何をやっても、彼はエマの命を救うことができない。
「過去をどうすれば変えられるのか？」という疑問に対する答えを、彼は未来に求めようとする。
だが21世紀の世界でも彼はその答えを見つけられない。
それどころか彼が見たのは、科学技術に溺れて地球そのものを破壊してしまう人類の姿だった。
アレクサンダーはさらに時間を下って、80万年後の世界を訪れる。
そこでは人類が地上で生活するイーロイ族と、地下で暮らすモーロック族の２系統に進化していた。