var filesystem;
var file;
var require;
filesystem = new ActiveXObject("Scripting.FileSystemObject");

WScript.StdOut.WriteLine("リネームしたいファイルの名を入力してください");
require = WScript.StdIn.ReadLine();
file = filesystem.GetFile(require);
WScript.StdOut.WriteLine("新しいファイル名を入れてください");
require = WScript.StdIn.ReadLine();
file.Name = require;
WScript.StdOut.WriteLine("リネームされました");
WScript.Quit(0);

ヘルプみながらサンプル書いてみたよ～