心に深い傷を負ったルナマリア（坂本真綾）は、その怒りをロゴスとの戦いに転化すべく、インパルスの調整に没頭していた。 
アスラン（石田彰）とメイリンの件で負い目を感じるシン（鈴村健一）は、ルナマリアとひととき心を通わせ合う。 
デュランダル（池田秀一）から最後通告を突きつけられていた地球連合軍は、回答もなしに突如戦闘を開始した。 
先陣を務めるのは、新たに用意されたデストロイ５機…。 
その中には、ベルリンの攻防戦でカオスを撃墜されたスティングの姿もあった。