> なあ会社に対しては御社だけど
> 協会に対してはなんて言うの？御会？

御社は口頭用語。筆耕用語は貴社です。
質問例の場合は、前者は貴社。後者は総じて貴所。
細分化すれば、貴協会となります。

参考：2010/01/19(火)21時24分31秒