人類の最後の希望として建造中のヤマト だがそれは口実で特権階級が地球を脱出するための船だった そして一方ガミラスとイスカンダル イスカンダル星のスターシャは種族の生き残りをかけコスモクリーナーDによる地球支配の陰謀を張り巡らせていた