庵野は一時期同人誌を集めるほどに『美少女戦士セーラームーン』にハマっていた。
そのため『美少女戦士セーラームーン』の登場人物・月野うさぎの声優を務めた三石琴乃を葛城ミサトの声優に起用したり、
綾波レイの名前が火野レイより採られている。また、緒方恵美が『美少女戦士セーラームーン』の劇場版第1作目に地場衛の
少年時代の役で出演しており、その演技を見て、本作の主人公・碇シンジ役に決定したと語っている。
その他、プライベートでも親交のある『美少女戦士セーラームーン』の主要スタッフの一人である幾原邦彦を渚カヲルのモデルとしている。