俺の知る限りでは現代まだ活動してる忍者組織は
甲賀流忍者軍団瀧組
http://www.water.sannet.ne.jp/shinobi/index.htm
伊賀流忍者
http://www.iganinja.jp/japanese/menu.html
忍法戸隠流武神館道場
http://www001.upp.so-net.ne.jp/bujinkan/nagasesp.htm
あたりだな(;´Д`)長瀬楓さんは伊賀だっけ？